Začínáme pracovat

Stáhněte instalátor Atomic Wallet pro váš operační systém ze stránky stahování. Spusťte stažený soubor a postupujte podle pokynů průvodce instalací.

Po dokončení instalace spusťte Atomic Wallet přes zástupce na ploše nebo z nabídky aplikací.

Při prvním spuštění uvidíte hlavní okno aplikace, které se skládá z několika oblastí:

• Panel nástrojů — основные инструменты для pracovat с molekulами
• 3D viewport — область просмотра и редактирования molekulы
• Panel vlastností — informace o vybraných atomech a vazbách
• Knihovna — доступ к готовым molekulам и элементам

Vytvořte nový projekt přes menu Soubor → Nový nebo stiskněte Ctrl+N. Vyberte prvek z periodické tabulky a klikněte v oblasti zobrazení pro přidání atomu.

Pro vytvoření vazby mezi atomy vyberte nástroj "Vazba" na panelu nástrojů a postupně klikněte na dva atomy.

Použijte myš pro navigaci v trojrozměrném prostoru:

Akce	Ovládání
Rotace	Stiskněte levé tlačítko myši a pohybujte
Přesun	Stiskněte střední tlačítko myši a pohybujte
Škálování	Rolování kolečka myši
Reset zobrazení	Home или Numpad 0

Вместо создания molekulы с нуля вы можете воспользоваться встроенной библиотекой. Откройте панель библиотеки и выберите нужную molekulу z kategorií:

• Простые molekulы (вода, аммиак, метан и др.)
• Organické соединения
• Aminokyseliny
• Nukleotidy
• Léky

Uložte projekt přes Soubor → Uložit (Ctrl+S). Pro export do jiných formátů použijte Soubor → Export.

Dostupné formáty exportu:

• PDB — Protein Data Bank
• XYZ — jednoduchý textový formát souřadnic
• MOL/MOL2 — MDL Molfile
• CIF — Crystallographic Information File
• PNG/JPG — obrázky vysoké kvality